19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4531 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4531  hypothetical protein  100 
 
 		 52 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  80.77 
 
 		 514 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  80.77 
 
 		 507 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1736  integrase, catalytic region  80.77 
 
 		 204 aa  84.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 		 517 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 512 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 512 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 512 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 		 512 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3381  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  47.83 
 
 		 512 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 525 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 513 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 505 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  40.38 
 
 		 518 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  40.38 
 
 		 518 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  40.38 
 
 		 518 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  38.46 
 
 		 517 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 385 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.694464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>