13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4329 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4329  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  842    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3751  hypothetical protein  30 
 
 		 373 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  30.2 
 
 		 721 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  24.46 
 
 		 549 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6308  hypothetical protein  27.13 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  24.14 
 
 		 597 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1519  hypothetical protein  24.9 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5184  type IV secretory pathway, putative conjugative relaxase  24.9 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  24.38 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5612  hypothetical protein  22.46 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6503  hypothetical protein  24.05 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.842994 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  26.09 
 
 		 990 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  30.36 
 
 		 485 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>