16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3855 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3855  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0328  hypothetical protein  61.15 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3753  hypothetical protein  56.23 
 
 
288 aa  289  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3997  hypothetical protein  55.52 
 
 
306 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742169  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2492  hypothetical protein  56.36 
 
 
281 aa  280  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000428836 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00473  hypothetical protein  53.24 
 
 
284 aa  266  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2455  hypothetical protein  50.35 
 
 
289 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1328  hypothetical protein  54.04 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977322  normal  0.0373251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2274  hypothetical protein  51.05 
 
 
294 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2784  hypothetical protein  51.24 
 
 
325 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290619  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3648  hypothetical protein  32.53 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  27.5 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  27.01 
 
 
401 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  29.55 
 
 
483 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3640  ParB-like nuclease  25.13 
 
 
419 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  23.15 
 
 
507 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>