15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2703 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  100 
 
 
208 aa  427  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  48.31 
 
 
203 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  47.83 
 
 
203 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  45.93 
 
 
204 aa  179  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0549  NIPSNAP  43.27 
 
 
204 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2424  NIPSNAP family protein  44.08 
 
 
203 aa  161  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.049725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  41.83 
 
 
204 aa  157  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  40.19 
 
 
204 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  40.19 
 
 
204 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  40.19 
 
 
204 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0413  NIPSNAP domain-containing protein  31.1 
 
 
203 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  30.92 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  23.11 
 
 
317 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  37.5 
 
 
104 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  32.89 
 
 
107 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>