38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0409 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0409  transposase, IS4  100 
 
 		 55 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373332 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5975  IS4 family transposase  70.91 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6786  transposase IS4 family protein  63.64 
 
 		 368 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1171  IS4 family transposase  67.27 
 
 		 366 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3353  IS4 family transposase  67.27 
 
 		 366 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4153  transposase ISRme1  67.27 
 
 		 366 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.504697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4228  transposase ISRme1  67.27 
 
 		 366 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00917968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6134  transposase IS4 family protein  63.64 
 
 		 368 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.647313  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4959  transposase IS4 family protein  63.64 
 
 		 368 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3230  transposase IS4 family protein  63.64 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4641  transposase, IS4  65.45 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.395706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4885  transposase IS4 family protein  63.64 
 
 		 368 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  61.82 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00235  putative ISXoo14 transposase  52.73 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2894  transposase, IS4 family protein  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457818  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1527  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.717674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2279  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2594  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2770  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3984  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3889  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3700  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3687  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3098  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2726  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0495453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1112  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0987  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3131  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347053  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5376  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6302  transposase, IS4 family protein  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5960  transposase, IS4 family protein  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5505  transposase, IS4 family protein  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5596  transposase, IS4  46.94 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  48.08 
 
 		 405 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2597  ISGsu2, transposase  46.94 
 
 		 361 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1297  ISGsu2, transposase  46.94 
 
 		 361 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0559  ISGsu2, transposase  46.94 
 
 		 361 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360108  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3062  transposase  44.23 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>