14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3324 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3324  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56800  hypothetical protein  56.16 
 
 		 300 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0090  hypothetical protein  34.26 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2799  hypothetical protein  34.65 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1607  hypothetical protein  35.21 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.122022  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0006  hypothetical protein  33.07 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0549  hypothetical protein  29.76 
 
 		 641 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210535  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2926  hypothetical protein  29.41 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  26.98 
 
 		 433 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  30.46 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  29.19 
 
 		 434 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  28.07 
 
 		 434 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1228  hypothetical protein  30.23 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0145255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1117  hypothetical protein  38.98 
 
 		 224 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>