11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1117 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1117  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0199  hypothetical protein  40.11 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4542  hypothetical protein  36.45 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01925  aspartyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4541  hypothetical protein  28.7 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2926  hypothetical protein  34.94 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3324  hypothetical protein  29.17 
 
 		 301 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56800  hypothetical protein  30.83 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3832  hypothetical protein  28.86 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1735  hypothetical protein  31.01 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.787256 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  32.74 
 
 		 434 aa  42  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>