18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56800 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_56800  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3324  hypothetical protein  56.16 
 
 		 301 aa  315  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2799  hypothetical protein  36.43 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0090  hypothetical protein  37.35 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0006  hypothetical protein  32.41 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1607  hypothetical protein  33.96 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.122022  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  29.95 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0549  hypothetical protein  31.8 
 
 		 641 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210535  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  28.72 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2926  hypothetical protein  31.66 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  29.59 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1228  hypothetical protein  33.61 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0145255  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  28.42 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04780  hypothetical protein  30.57 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2590  hypothetical protein  32 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0168654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1117  hypothetical protein  30.83 
 
 		 224 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2719  hypothetical protein  28.75 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1067  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105525  hitchhiker  0.0000000418478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>