15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2799 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2799  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  617  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1607  hypothetical protein  39.13 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.122022  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0090  hypothetical protein  37.97 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56800  hypothetical protein  36.43 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3324  hypothetical protein  34.65 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0006  hypothetical protein  34.1 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0549  hypothetical protein  30.34 
 
 		 641 aa  93.2  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  29.65 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  29.23 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1228  hypothetical protein  29.55 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0145255  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  27.32 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2926  hypothetical protein  40.26 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2908  hypothetical protein  30.23 
 
 		 263 aa  45.8  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  29.63 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3832  hypothetical protein  32.88 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>