13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2112 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2112  zonular occludens toxin  100 
 
 		 396 aa  825    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  0.0869941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1399  Zonular occludens toxin  31.88 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0437506  normal  0.88408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2548  Zonular occludens toxin  32.68 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1395  Zonular occludens toxin  32.09 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00397703  normal  0.781405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0719  zonular occludens toxin  30.48 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2097  zonular occludens toxin  28.12 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0844  Zonular occludens toxin  27.6 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00558  hypothetical protein  28.96 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.65599  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0971  zonular occludens toxin  24.71 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0985  zonular occludens toxin  24.71 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.51619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3909  toxin  29.09 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3268  hypothetical protein  30.5 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4473  Zonular occludens toxin  26.32 
 
 		 448 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272014  hitchhiker  0.0000467157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>