138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0428 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0428    100 
 
 		 459 bp  910    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0915    84.06 
 
 		 979 bp  329  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  82.97 
 
 		 981 bp  289  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  82.97 
 
 		 981 bp  289  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  82.97 
 
 		 981 bp  289  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  82.97 
 
 		 981 bp  289  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  82.26 
 
 		 981 bp  260  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  82.76 
 
 		 981 bp  250  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  79.01 
 
 		 984 bp  141  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24610  Transposase, IS4  87.5 
 
 		 144 bp  103  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2598  ISRSO18-transposase protein  84.92 
 
 		 960 bp  99.6  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  83.22 
 
 		 984 bp  97.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0382  ISRSO18-transposase protein  84.38 
 
 		 960 bp  95.6  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0605  ISRSO18-transposase protein  84.38 
 
 		 960 bp  95.6  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  82.55 
 
 		 981 bp  89.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  79.4 
 
 		 981 bp  81.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5627    77.81 
 
 		 495 bp  79.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05526  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06239  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05555    85.26 
 
 		 927 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1779    88.73 
 
 		 275 bp  77.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05639  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00267  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00278  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00284  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00368  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01500  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01751  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01862  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02541    85.26 
 
 		 894 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03194  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04167  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04676  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  85.26 
 
 		 969 bp  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05577  ISXo1 transposase  89.23 
 
 		 969 bp  73.8  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1381    82.17 
 
 		 1326 bp  73.8  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01858  ISXo1 transposase  89.23 
 
 		 969 bp  73.8  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  89.23 
 
 		 969 bp  73.8  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04034  ISXo1 transposase  89.23 
 
 		 969 bp  73.8  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  81.89 
 
 		 993 bp  69.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  86.49 
 
 		 963 bp  67.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2927  transposase, IS4 family protein  80.38 
 
 		 960 bp  67.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5898    97.3 
 
 		 602 bp  65.9  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  81.67 
 
 		 984 bp  63.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01973  hypothetical protein  81.67 
 
 		 216 bp  63.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0141734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  81.67 
 
 		 963 bp  63.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  81.67 
 
 		 1218 bp  63.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  81.67 
 
 		 963 bp  63.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7786    94.74 
 
 		 952 bp  60  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.619604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  89.8 
 
 		 981 bp  58  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  89.8 
 
 		 981 bp  58  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  89.8 
 
 		 981 bp  58  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  89.8 
 
 		 981 bp  58  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  89.8 
 
 		 981 bp  58  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  92.68 
 
 		 984 bp  58  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  89.8 
 
 		 981 bp  58  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  89.8 
 
 		 981 bp  58  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  89.8 
 
 		 981 bp  58  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  89.8 
 
 		 981 bp  58  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  89.8 
 
 		 981 bp  58  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3099  transposase, IS4  86.89 
 
 		 336 bp  58  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04736  ISXoo6 transposase  91.11 
 
 		 924 bp  58  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04727  ISXoo6 transposase  80.83 
 
 		 810 bp  56  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.714363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  80.83 
 
 		 990 bp  56  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  80.83 
 
 		 981 bp  56  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0590  transposase, IS4 family protein  84.51 
 
 		 981 bp  54  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.605879  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1459  transposase, IS4 family protein  84.51 
 
 		 981 bp  54  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2004  transposase, IS4 family protein  84.51 
 
 		 981 bp  54  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.094383  normal  0.686139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2954  transposase, IS4 family protein  84.51 
 
 		 963 bp  54  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3096  transposase, IS4 family protein  84.51 
 
 		 981 bp  54  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0728273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3367  transposase, IS4 family protein  84.51 
 
 		 981 bp  54  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105389  normal  0.324658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3426  transposase, IS4 family protein  84.51 
 
 		 981 bp  54  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3766  transposase, IS4 family protein  84.51 
 
 		 981 bp  54  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04848  ISXoo6 transposase  81.82 
 
 		 1020 bp  54  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  83.13 
 
 		 996 bp  54  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  85.48 
 
 		 951 bp  52  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00519  ISXoo6 transposase  83.78 
 
 		 924 bp  52  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  90.24 
 
 		 978 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  90.24 
 
 		 978 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  90.24 
 
 		 978 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  90.24 
 
 		 978 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  90.24 
 
 		 978 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  90.24 
 
 		 978 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  90.24 
 
 		 978 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  90.24 
 
 		 1017 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  90.24 
 
 		 978 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  90.24 
 
 		 978 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  90.24 
 
 		 978 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>