27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1850 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1850  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  573  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2882  hypothetical protein  42.21 
 
 
282 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1067  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
234 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  30.61 
 
 
237 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.87 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
255 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
239 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  23.78 
 
 
401 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
208 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  27.81 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  28.3 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  26.14 
 
 
400 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  32 
 
 
251 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  25.56 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.49 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  32.94 
 
 
238 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
584 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  32.05 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  30 
 
 
241 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
225 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
237 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
235 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>