29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1064 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
129 aa  259  8e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.81 
 
 
131 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0951  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.04 
 
 
135 aa  141  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0373454  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.36 
 
 
134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1162  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.49 
 
 
129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3050  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.61 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.12 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1660  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.16 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.61 
 
 
138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.72 
 
 
129 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.19 
 
 
133 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.79 
 
 
126 aa  90.5  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.92 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.6 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.77 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.35 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.77 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.78 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1880  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.98 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.987972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2774  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  23.26 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.141891  normal  0.534011 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.25 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.25 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.56 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.92 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.56 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.56 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.56 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.56 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.56 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>