32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0589 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0589  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  296  7e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  62.91 
 
 
156 aa  166  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  62.25 
 
 
159 aa  164  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1771  hypothetical protein  60.96 
 
 
166 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1117  hypothetical protein  53.1 
 
 
158 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  55.1 
 
 
153 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  54.67 
 
 
156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  36.57 
 
 
150 aa  90.5  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  36.64 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  31.88 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  32.88 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  32.39 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  32.64 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  32.64 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  32.82 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  32.09 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  29.08 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1659  hypothetical protein  32.37 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  30.77 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  30.37 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  31.51 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  25.85 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  29.33 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2956  hypothetical protein  30.6 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  36 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0286  hypothetical protein  28.06 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  25.4 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0709  hypothetical protein  35.06 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0634  hypothetical protein  35.37 
 
 
171 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.170489  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1200  hypothetical protein  26.53 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>