30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3235 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1095  NERD domain-containing protein  37.05 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00991797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  33.86 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  34.9 
 
 		 304 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  30.65 
 
 		 321 aa  95.1  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  27.87 
 
 		 298 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  27.87 
 
 		 298 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  27.87 
 
 		 298 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3140  hypothetical protein  28.45 
 
 		 300 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  34.09 
 
 		 298 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  28.52 
 
 		 308 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  29.61 
 
 		 310 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0264  hypothetical protein  29.41 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.8207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  30.6 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  31.62 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  29.05 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  29.06 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  26.67 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  26.92 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  27.61 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  34.12 
 
 		 355 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  37.08 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  43.64 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  41.07 
 
 		 331 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  29.11 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  37.88 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  43.48 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  43.48 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  36.47 
 
 		 281 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>