13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3220 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3220  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  817    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2655  hypothetical protein  34.72 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  38.6 
 
 		 1064 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  35.29 
 
 		 1007 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  32.78 
 
 		 1023 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1037  hypothetical protein  33.93 
 
 		 174 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  33.14 
 
 		 1053 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  31.52 
 
 		 1049 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  30.77 
 
 		 1049 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 809 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1708  hypothetical protein  30.68 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1711  hypothetical protein  25.66 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  27.32 
 
 		 514 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>