17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2956 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2956  Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly-like protein  100 
 
 		 328 aa  651    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1786  cytochrome oxidase assembly  34.51 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  32.46 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  27.65 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  29.59 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  29.59 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  28.19 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  27.41 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  27.6 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  27.5 
 
 		 311 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  29.61 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  29.36 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.21 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  31.45 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  27.96 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  28.95 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  33.61 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>