26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1274 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1274  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  746    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2834  hypothetical protein  36.81 
 
 		 352 aa  195  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184431  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1987  squalene-hopene cyclase-like protein  36.62 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.374107  normal  0.15857 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1414  hypothetical protein  31.83 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1146  hypothetical protein  32.35 
 
 		 499 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.837479  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1459  hypothetical protein  28.93 
 
 		 761 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1124  hypothetical protein  28.02 
 
 		 507 aa  116  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1123  hypothetical protein  27.87 
 
 		 500 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2004  hypothetical protein  22.89 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0480626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1752  hypothetical protein  26.01 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0554634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0829  hypothetical protein  22.8 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0306  A-macroglobulin complement component  24.19 
 
 		 827 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0700  prenyltransferase/squalene oxidase  35.82 
 
 		 725 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0951082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2556  squalene cyclase  30.53 
 
 		 653 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511022  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3175  squalene-hopene cyclase  30.08 
 
 		 657 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5504  squalene-hopene cyclase  30 
 
 		 657 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209876  normal  0.0256677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0812  squalene-hopene cyclase  29.55 
 
 		 654 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158231  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4137  squalene-hopene cyclase  32.94 
 
 		 677 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4951  squalene-hopene cyclase  29.17 
 
 		 657 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736263  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2394  squalene-hopene cyclase  29.17 
 
 		 657 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3161  squalene-hopene cyclase  29.17 
 
 		 657 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3275  squalene-hopene cyclase  29.17 
 
 		 657 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1409  squalene-hopene cyclase  29.17 
 
 		 657 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.525884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1129  squalene-hopene cyclase  29.17 
 
 		 657 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1490  squalene-hopene cyclase  29.17 
 
 		 651 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2100  squalene-hopene cyclase  29.17 
 
 		 651 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>