25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2169 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  100 
 
 		 700 aa  1363    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0209  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1131 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  28.98 
 
 		 633 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  34.03 
 
 		 847 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  34.03 
 
 		 854 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  29.38 
 
 		 857 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1312  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1076 aa  79.7  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4479  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1057 aa  77.4  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  30.94 
 
 		 702 aa  74.3  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  26.37 
 
 		 888 aa  73.9  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  28 
 
 		 712 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  30 
 
 		 891 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  29.14 
 
 		 863 aa  68.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  25.25 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  26.79 
 
 		 882 aa  67.8  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  27.66 
 
 		 863 aa  67  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  24.83 
 
 		 707 aa  63.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1072  hypothetical protein  22.11 
 
 		 851 aa  62  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.635494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1120  hypothetical protein  25.97 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000538221  normal  0.614169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  31.76 
 
 		 860 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4966  hypothetical protein  20.77 
 
 		 1093 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1071  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  48.1  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.107343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1104 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1307 aa  45.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1481  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1100 aa  45.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>