17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2761 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2761  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  246  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0382  hypothetical protein  58.26 
 
 
122 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100866  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0222  hypothetical protein  51.35 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1678  hypothetical protein  41.25 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  34.38 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0802  hypothetical protein  34.65 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002239  hypothetical protein  33.03 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  34.65 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3106  hypothetical protein  32.11 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  37.65 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00129  hypothetical protein  35.51 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  43.55 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2830  hypothetical protein  35.09 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1638  hypothetical protein  38.67 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.538048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6628  VanZ family protein  32.67 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.13931 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0188  VanZ family protein  30.56 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.68802  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  29.36 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>