59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2143 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2143  hypothetical protein  100 
 
 
757 aa  1544    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.544193  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2584  hypothetical protein  69.3 
 
 
777 aa  1132    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0639598  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001078  hypothetical protein  46.58 
 
 
748 aa  717    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.259566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1007  hypothetical protein  43.16 
 
 
771 aa  686    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0649  hypothetical protein  28.15 
 
 
809 aa  303  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00490062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3287  hypothetical protein  28.47 
 
 
813 aa  289  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4106  PHP domain protein  26.36 
 
 
460 aa  67  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  24.4 
 
 
480 aa  62.4  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2555  PHP domain protein  25.61 
 
 
425 aa  60.8  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  30.05 
 
 
225 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  25.91 
 
 
452 aa  58.5  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  24.11 
 
 
460 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  35.85 
 
 
279 aa  57.8  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2798  hypothetical protein  23.18 
 
 
475 aa  57.4  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.44646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4132  hypothetical protein  23.46 
 
 
482 aa  54.3  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  35.53 
 
 
278 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  32.26 
 
 
407 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1406  PHP domain-containing protein  29.46 
 
 
403 aa  51.6  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407213  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2462  PHP, C-terminal  27.5 
 
 
295 aa  50.8  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.735424  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1683  PHP domain protein  32.95 
 
 
301 aa  50.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  28.57 
 
 
286 aa  50.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  29.87 
 
 
286 aa  48.5  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  31.4 
 
 
286 aa  48.5  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5406  PHP-like metal-dependent phosphoesterase  31.33 
 
 
279 aa  48.5  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  26.44 
 
 
221 aa  48.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2100  phosphotransferase domain-containing protein  30.12 
 
 
279 aa  47.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5977  PHP-like  30.12 
 
 
279 aa  47.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2118  phosphotransferase domain-containing protein  30.12 
 
 
279 aa  47.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317755 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  30.3 
 
 
284 aa  47.4  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  28.91 
 
 
228 aa  47.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2487  phosphoesterase, PHP-like  27.73 
 
 
255 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2010  phosphotransferase domain-containing protein  30.11 
 
 
276 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000228692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  34.94 
 
 
284 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0704  PHP domain protein  38.46 
 
 
280 aa  47.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  28 
 
 
269 aa  47  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  22.67 
 
 
458 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
224 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2137  phosphotransferase domain-containing protein  30.12 
 
 
276 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1370  PHP domain protein  27.83 
 
 
267 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  23.03 
 
 
486 aa  45.8  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2309  PHP domain protein  26.23 
 
 
290 aa  46.2  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  25.48 
 
 
228 aa  45.8  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  29.17 
 
 
286 aa  45.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  30.12 
 
 
322 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  33.85 
 
 
278 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1432  phosphotransferase domain-containing protein  28.24 
 
 
277 aa  45.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1580  hypothetical protein  28.92 
 
 
276 aa  44.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1848  putative phosphoesterase  24.11 
 
 
282 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  hitchhiker  0.000620806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2553  PHP domain protein  27.71 
 
 
276 aa  44.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000196897  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  35.48 
 
 
296 aa  44.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  25.43 
 
 
221 aa  44.3  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1926  hypothetical protein  25.3 
 
 
295 aa  44.3  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  35.48 
 
 
274 aa  44.3  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1467  PHP domain protein  26.96 
 
 
266 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.23 
 
 
1535 aa  44.3  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  35.38 
 
 
277 aa  44.3  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1607  putative phosphoesterase  24.11 
 
 
282 aa  44.3  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728178 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1853  putative phosphoesterase  24.11 
 
 
282 aa  44.3  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1597  phosphotransferase domain-containing protein  26.04 
 
 
221 aa  43.9  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>