50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1236 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  74.23 
 
 		 284 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  64.29 
 
 		 291 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3134  hypothetical protein  57.62 
 
 		 292 aa  321  6e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2439  MadN protein  58.87 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  57.3 
 
 		 292 aa  318  5e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  57.3 
 
 		 292 aa  317  9e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  52.65 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1302  MadN protein  52.67 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  51.91 
 
 		 286 aa  278  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  51.53 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1276  hypothetical protein  50.97 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00521241  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.76 
 
 		 299 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.96 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.96 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  49.62 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0261  hypothetical protein  53.96 
 
 		 290 aa  261  8.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  48.48 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.54 
 
 		 289 aa  255  5e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0684  hypothetical protein  47.49 
 
 		 287 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0339  hypothetical protein  52.43 
 
 		 292 aa  248  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.252118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.95 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1597  hypothetical protein  48.68 
 
 		 292 aa  246  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.483215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0183  carboxylate/amino acid/amine transporter  48.52 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1433  carboxylate/amino acid/amine transporter  48.28 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720857  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  46.21 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  46.21 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  46.21 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  46.21 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  46.21 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  46.21 
 
 		 299 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.21 
 
 		 299 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.21 
 
 		 299 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0864049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4537  carboxylate/amino acid/amine transporter  48.66 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1354  carboxylate/amino acid/amine transporter  48.66 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.117278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1301  carboxylate/amino acid/amine transporter  53.33 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4083  hypothetical protein  49.04 
 
 		 292 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1652  hypothetical protein  51.53 
 
 		 286 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19150  hypothetical protein  51.15 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.475633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4043  carboxylate/amino acid/amine transporter  48.48 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3830  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.89 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3822  hypothetical protein  49.04 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0974  conserved hypothetical protein, MadN family (DUF6 domain protein)  45.62 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.634271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  36.15 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.62 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.51 
 
 		 310 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  26.34 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  27.91 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0070  hypothetical protein  23.53 
 
 		 295 aa  42  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.623424  hitchhiker  0.00000000180064 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1614  hypothetical protein  26.8 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.90138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>