14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0848 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0848  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  866    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2317  hypothetical protein  42.83 
 
 		 465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.89603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1782  gamma-D-glutamate-meso-diaminopimelate muropeptidase  45.68 
 
 		 559 aa  176  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.314104  normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3250  hypothetical protein  46.4 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.627274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3251  hypothetical protein  42.45 
 
 		 474 aa  163  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0846  hypothetical protein  36.53 
 
 		 439 aa  150  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2560  hypothetical protein  34.91 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153155  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3248  hypothetical protein  35.69 
 
 		 749 aa  123  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1183 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1700 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  28.95 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  34.78 
 
 		 739 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  30.4 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  32.67 
 
 		 892 aa  43.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>