29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0464 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 133 aa  270  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.36 
 
 		 131 aa  153  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3050  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.91 
 
 		 136 aa  147  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1162  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.71 
 
 		 129 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0951  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.16 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0373454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.12 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1660  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.74 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.7 
 
 		 134 aa  120  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.62 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.19 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.24 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2774  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.32 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.141891  normal  0.534011 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.6 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.6 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.4 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.98 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.56 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.23 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0850  F0F1-type ATP synthase epsilon subunit-like protein  25.23 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.41 
 
 		 151 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.32 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.32 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.32 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.32 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.32 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.32 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24.22 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0316883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>