17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1537 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1537  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  815    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.522426  normal  0.175013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  27.96 
 
 		 445 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  27.59 
 
 		 458 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2424  hypothetical protein  29.25 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.481208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1793  hypothetical protein  28.37 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0265229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0242  hypothetical protein  27.3 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1137  hypothetical protein  25.91 
 
 		 444 aa  86.7  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0252196  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01235  hypothetical protein  23.16 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  33.54 
 
 		 698 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3891  hypothetical protein  26.93 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0609  neutral invertase  28.66 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00065977  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2774  neutral invertase  26.32 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4707  neutral invertase  26.58 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  21.91 
 
 		 610 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  32.56 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.89 
 
 		 565 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.29 
 
 		 732 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>