18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0462 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0462  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  821    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3667  hypothetical protein  47.04 
 
 
427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4622  hypothetical protein  45.63 
 
 
427 aa  293  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0984067  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0810  hypothetical protein  53.74 
 
 
426 aa  246  4e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.450198  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0050  hypothetical protein  36.75 
 
 
449 aa  206  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0035  hypothetical protein  36.36 
 
 
449 aa  205  9e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0074  hypothetical protein  36.75 
 
 
449 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.477349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1240  hypothetical protein  34.73 
 
 
373 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1732  hypothetical protein  34.48 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2038  hypothetical protein  36.77 
 
 
424 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0075  hypothetical protein  37.76 
 
 
424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5031  hypothetical protein  34.5 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0215  hypothetical protein  31.73 
 
 
426 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3844  hypothetical protein  33.75 
 
 
437 aa  180  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3782  hypothetical protein  32.84 
 
 
427 aa  169  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1755  hypothetical protein  30.75 
 
 
425 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1783  hypothetical protein  30.75 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl427  chromosome segregation ATPase  29.82 
 
 
479 aa  52.8  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000465666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>