38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4742 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0955  hypothetical protein  56.44 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1115  hypothetical protein  54.37 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1065  hypothetical protein  52.83 
 
 		 174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3176  hypothetical protein  44.87 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3020  hypothetical protein  41.4 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  34.62 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2435  hypothetical protein  37.06 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  36.91 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  33.12 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2733  hypothetical protein  42.65 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1834  hypothetical protein  37.42 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  37.11 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  39.38 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  37.65 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  32.32 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  39.05 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  35.62 
 
 		 181 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0125  hypothetical protein  37.2 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0459  hypothetical protein  45.03 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  39.09 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0817  hypothetical protein  41.96 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  33.54 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5848  hypothetical protein  35.57 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  36.61 
 
 		 193 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  36.61 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  36.61 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  36.61 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1488  hypothetical protein  32.72 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2465  hypothetical protein  28.66 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  36.63 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01776  hypothetical protein  31.76 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6579  hypothetical protein  33.96 
 
 		 195 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1486  hypothetical protein  32.47 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1004  hypothetical protein  32.47 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003860  hypothetical protein  31.25 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01819  hypothetical protein  31.21 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1485  hypothetical protein  37.11 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>