13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2889 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2889  HvnB; halovibrin  100 
 
 		 309 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2507  HvnC; halovibrin  53.8 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1888  HvnB; halovibrin  44.67 
 
 		 309 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000699147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2651  HvnA; halovibrin  41.77 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4705  HvnC; halovibrin  39.68 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  37.62 
 
 		 507 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3885  hypothetical protein  40.79 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3886  hypothetical protein  41.18 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4703  hypothetical protein  40.37 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3370  hypothetical protein  37.12 
 
 		 408 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39780  hypothetical protein  38.18 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2759  hypothetical protein  30.72 
 
 		 431 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2758  hypothetical protein  27.03 
 
 		 558 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>