13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2651 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2651  HvnA; halovibrin  100 
 
 		 316 aa  658    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2507  HvnC; halovibrin  42.9 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4705  HvnC; halovibrin  48.68 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1888  HvnB; halovibrin  44.44 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000699147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  42.12 
 
 		 507 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2889  HvnB; halovibrin  43.24 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3885  hypothetical protein  41.8 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4703  hypothetical protein  45.23 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3886  hypothetical protein  41.03 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39780  hypothetical protein  40.15 
 
 		 408 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3370  hypothetical protein  38.71 
 
 		 408 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2759  hypothetical protein  32.04 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2758  hypothetical protein  26.88 
 
 		 558 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>