38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0981 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0981  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1259  hypothetical protein  81.03 
 
 
311 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14170  hypothetical protein  80.71 
 
 
311 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3552  glutathione S-transferase-like protein  75.88 
 
 
311 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872782  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1263  hypothetical protein  73.31 
 
 
310 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1081  hypothetical protein  72.03 
 
 
310 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11360  hypothetical protein  63.67 
 
 
311 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596022  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  49.03 
 
 
315 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1438  Glutathione S-transferase domain  46.01 
 
 
318 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44949  normal  0.0129155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  48.55 
 
 
312 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1479  Glutathione S-transferase domain protein  44.73 
 
 
318 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627969  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  46.15 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1783  putative glutathione S-transferase-related protein  48.23 
 
 
310 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1768  putative glutathione S-transferase-related protein  45.69 
 
 
318 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.628601  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  46.79 
 
 
312 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2869  putative glutathione S-transferase-related protein  44.16 
 
 
318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2004  putative glutathione S-transferase-related protein  45.19 
 
 
308 aa  258  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1699  putative glutathione S-transferase-related protein  44.87 
 
 
308 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1847  putative glutathione S-transferase-related protein  42.44 
 
 
310 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  40.06 
 
 
310 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03487  conserved hypothetical protein  29.68 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.67628  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  29.95 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  27.09 
 
 
239 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  27.27 
 
 
241 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  26.11 
 
 
239 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  29.9 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  26.6 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.92 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  27.69 
 
 
263 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  25.37 
 
 
263 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  25.37 
 
 
263 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  25.25 
 
 
241 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  28.49 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  23.81 
 
 
241 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.71 
 
 
200 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  29.03 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0362  glutathione S-transferase-like protein  27.03 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00749625  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29981  predicted protein  25.68 
 
 
311 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>