31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3739 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  100 
 
 		 322 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  42.95 
 
 		 338 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  42.5 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  33.23 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  34.95 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  32.28 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  31.11 
 
 		 374 aa  149  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  42.44 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  32.52 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  34.15 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  31.33 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  33.53 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  30.41 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  32.31 
 
 		 342 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  33.44 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  31.61 
 
 		 358 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  34.55 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  32.09 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  32.89 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  33.23 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  33.97 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  45.65 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  30.5 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  28.78 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  27.75 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0591  hypothetical protein  28.06 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4009  hypothetical protein  28.85 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  24.38 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4068  Phage-related protein endonuclease-like  25.48 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  25.5 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2639  phage-related protein endonuclease-like protein  26.09 
 
 		 316 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>