More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0707 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0707  inositol monophosphatase  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2169  inositol monophosphatase family protein  75.88 
 
 		 261 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  75.88 
 
 		 261 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  75.49 
 
 		 261 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  72.2 
 
 		 261 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  71.26 
 
 		 264 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  67.05 
 
 		 264 aa  362  5.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  61.29 
 
 		 263 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  58.47 
 
 		 266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  58.78 
 
 		 266 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  57.96 
 
 		 263 aa  294  9e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  51.74 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  57.55 
 
 		 263 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  57.55 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  57.55 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0159  inositol monophosphatase family protein  55.04 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  50.97 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0612  Inositol-phosphate phosphatase  53.33 
 
 		 264 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0601  inositol-phosphate phosphatase  53.33 
 
 		 264 aa  285  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.406636  normal  0.0239837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0576  Inositol-phosphate phosphatase  52.94 
 
 		 264 aa  285  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  hitchhiker  0.0082747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1007  Inositol-phosphate phosphatase  51.35 
 
 		 262 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2740  inositol monophosphatase  53.28 
 
 		 263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0333138  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4474  inositol-1(or 4)-monophosphatase  51.35 
 
 		 262 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4776  inositol-1(or 4)-monophosphatase  51.35 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  54.58 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4320  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.19 
 
 		 262 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3507  inositol-phosphate phosphatase  50.38 
 
 		 265 aa  278  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.991426  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1707  inositol-phosphate phosphatase  56.98 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.168895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  51.55 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3553  inositol monophosphatase  57.36 
 
 		 266 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0746  inositol-phosphate phosphatase  54.4 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  51.76 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3256  Inositol-phosphate phosphatase  56.59 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0330057  normal  0.162821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  51.76 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1501  inositol monophosphatase  53.33 
 
 		 278 aa  272  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.421731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  49.42 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  49.03 
 
 		 263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  46.27 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2981  inositol-phosphate phosphatase  49.62 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1313  inositol-1(or 4)-monophosphatase  47.33 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.837993  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1957  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.19 
 
 		 274 aa  245  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  47.06 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  48.83 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  47.35 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  46.5 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  45.16 
 
 		 267 aa  235  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  46.43 
 
 		 273 aa  234  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  44.88 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  47.13 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  46.67 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  44.86 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  46.77 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  46.67 
 
 		 267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  49.03 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  47.56 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  43.7 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  43.7 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  43.7 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  43.7 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  44.49 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  43.7 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  46.48 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  45.78 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  44.49 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  44.49 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  44.71 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  46.53 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.91 
 
 		 263 aa  228  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  43.62 
 
 		 267 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  48.37 
 
 		 259 aa  228  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  43.36 
 
 		 266 aa  228  6e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  44.86 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  44.36 
 
 		 262 aa  228  9e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  45.49 
 
 		 262 aa  228  9e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  45.49 
 
 		 267 aa  228  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  44.49 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  44.98 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  48 
 
 		 268 aa  225  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  47.93 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  46.75 
 
 		 284 aa  224  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  46.12 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  46.12 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  47.6 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  46.12 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  46.34 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  47.2 
 
 		 271 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  46.67 
 
 		 266 aa  221  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  43.85 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  43.62 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  47.24 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.31 
 
 		 330 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  43.63 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  44.23 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  44.23 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  46.61 
 
 		 272 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  43.7 
 
 		 267 aa  218  8.999999999999998e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  44.75 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  44.18 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  45.31 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  43.58 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>