28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2258 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2258  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  154  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266107  normal  0.0441451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  63.08 
 
 		 69 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  47.76 
 
 		 67 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2262  protein of unknown function DUF1458  49.23 
 
 		 68 aa  74.3  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1621  protein of unknown function DUF1458  50.77 
 
 		 68 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694094  normal  0.69633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0658  hypothetical protein  47.76 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.870127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  44.78 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3035  protein of unknown function DUF1458  46.27 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  39.13 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  33.85 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  31.82 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  40 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  39.39 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2873  hypothetical protein  33.85 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.272861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  35.48 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1441  hypothetical protein  30.3 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.857436  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  38.1 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1727  protein of unknown function DUF1458  32.31 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  34.43 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  25.4 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0507  hypothetical protein  30.16 
 
 		 68 aa  42  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0075  hypothetical protein  33.87 
 
 		 71 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4069  hypothetical protein  33.85 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  33.85 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5942  hypothetical protein  35 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0881826  hitchhiker  0.00766382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1287  hypothetical protein  33.85 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  33.85 
 
 		 70 aa  40  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2850  protein of unknown function DUF1458  28.57 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>