30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0445 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0445  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 
162 aa  330  7.000000000000001e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2275  hypothetical protein  52.56 
 
 
172 aa  166  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0107  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.86 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03570  domain of unknown function (306) family  28.03 
 
 
265 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.08 
 
 
242 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1434  hypothetical protein  32.41 
 
 
284 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.25 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.25 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  29.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  29.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  29.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  29.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  29.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  29.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  29.73 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  29.73 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.21 
 
 
181 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.21 
 
 
181 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.21 
 
 
181 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.21 
 
 
181 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.21 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.06 
 
 
251 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.06 
 
 
251 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.12 
 
 
197 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2483  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.05 
 
 
280 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.897758  normal  0.934589 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0698  hypothetical protein  27.27 
 
 
299 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.87 
 
 
183 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0670  hypothetical protein  24.55 
 
 
295 aa  42.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.160004  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  27.05 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  24.35 
 
 
275 aa  40.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>