9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2888 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2888  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1568  hypothetical protein  41.11 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  31.9 
 
 		 346 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  31.29 
 
 		 354 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  30.86 
 
 		 630 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  26.95 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  28.07 
 
 		 339 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  29.21 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  29.52 
 
 		 448 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>