33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2792 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2792  hypothetical protein  100 
 
 		 802 aa  1625    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0177  outer membrane protein PgaA  31.31 
 
 		 826 aa  303  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.541075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4285  outer membrane protein PgaA  30.19 
 
 		 820 aa  272  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2131  outer membrane protein  27.43 
 
 		 822 aa  265  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2141  outer membrane protein  27.43 
 
 		 822 aa  265  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.115838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2241  outer membrane protein  27.48 
 
 		 824 aa  260  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01026  predicted outer membrane protein  27.59 
 
 		 807 aa  248  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01033  hypothetical protein  27.59 
 
 		 807 aa  248  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1266  outer membrane protein PgaA  27.59 
 
 		 807 aa  248  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.632553 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2572  outer membrane protein PgaA  27.59 
 
 		 807 aa  248  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.014315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4606  outer membrane protein PgaA  28.34 
 
 		 820 aa  246  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1144  outer membrane protein PgaA  27.33 
 
 		 807 aa  244  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0137  biofilm PGA synthesis protein PgaA precursor  27.96 
 
 		 798 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.764186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04328  HmsH  28.98 
 
 		 680 aa  238  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000786393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2716  HmsH protein  29.43 
 
 		 675 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0286  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  28.41 
 
 		 816 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0121559  normal  0.150632 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3766  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  28.09 
 
 		 821 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4843  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  28.09 
 
 		 821 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3419  hypothetical protein  26.22 
 
 		 876 aa  180  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4262  hypothetical protein  25.75 
 
 		 855 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667534  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4104  hypothetical protein  25.75 
 
 		 876 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.81202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1940  hypothetical protein  25.55 
 
 		 895 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3515  hypothetical protein  25.79 
 
 		 954 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4482  hypothetical protein  25.59 
 
 		 797 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.285214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3998  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1018 aa  167  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706875  normal  0.141155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  26.68 
 
 		 729 aa  54.3  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 686 aa  50.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  31.07 
 
 		 924 aa  48.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1069 aa  47  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 363 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 632 aa  45.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 363 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  22.35 
 
 		 837 aa  44.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>