33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1411 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1411  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  100 
 
 		 53 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0321891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  44.78 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0783  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  43.28 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.396298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  38.33 
 
 		 74 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  40 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  46.81 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0266  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  42.59 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00519486  normal  0.318668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  86.36 
 
 		 594 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  44.07 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2798  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  40 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.755848 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  46.67 
 
 		 211 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  36.76 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.37 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.37 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  81.82 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  52.63 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  39.34 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  42.37 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  61.54 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  66.67 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  46.67 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  62.96 
 
 		 256 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  39.06 
 
 		 599 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1316  zinc finger CDGSH-type domain protein  43.4 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864134  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  53.12 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0591  zinc finger CDGSH-type domain protein  54.55 
 
 		 229 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  68.18 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  72.73 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  61.54 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.15 
 
 		 516 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.74 
 
 		 516 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  46.88 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2606  hypothetical protein  39.47 
 
 		 80 aa  40  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>