37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1368 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1368  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  793    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.642046 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0394  hypothetical protein  68.11 
 
 
410 aa  532  1e-150  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1337  hypothetical protein  66.58 
 
 
403 aa  513  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.984704  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0271  hypothetical protein  65.32 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0555  Protein of unknown function DUF650  48.82 
 
 
397 aa  384  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0958  hypothetical protein  49.62 
 
 
399 aa  381  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0243215  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1830  hypothetical protein  52.63 
 
 
406 aa  363  4e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1781  hypothetical protein  47.16 
 
 
408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2047  hypothetical protein  35.34 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000156756  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0532  hypothetical protein  35.44 
 
 
407 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0199  hypothetical protein  39.43 
 
 
398 aa  237  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0593  hypothetical protein  33.51 
 
 
406 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0243  hypothetical protein  33.88 
 
 
406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1658  hypothetical protein  32.98 
 
 
406 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.487866  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0514  hypothetical protein  32.43 
 
 
431 aa  225  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00307015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0326  hypothetical protein  33.07 
 
 
406 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.25053  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0975  hypothetical protein  34.84 
 
 
385 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0226  Protein of unknown function DUF650  34.86 
 
 
396 aa  222  9e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0623  hypothetical protein  37.46 
 
 
410 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0943  hypothetical protein  37.83 
 
 
418 aa  206  6e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1571  hypothetical protein  36.87 
 
 
402 aa  202  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1128  hypothetical protein  36.27 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.157954  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2780  Protein of unknown function DUF650  33.76 
 
 
390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1863  hypothetical protein  35.13 
 
 
382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2157  hypothetical protein  33.16 
 
 
380 aa  192  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300379  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0317  hypothetical protein  39.35 
 
 
377 aa  190  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1209  hypothetical protein  38.53 
 
 
378 aa  190  4e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.7498 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1972  Protein of unknown function DUF650  37.77 
 
 
426 aa  189  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177811  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0584  hypothetical protein  32.9 
 
 
387 aa  189  7e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.183239  decreased coverage  0.000387048 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1859  Protein of unknown function DUF650  33.68 
 
 
408 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1702  hypothetical protein  34.2 
 
 
399 aa  186  6e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.456812  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1069  hypothetical protein  37.77 
 
 
366 aa  186  7e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1108  Protein of unknown function DUF650  35.43 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0310  Protein of unknown function DUF650  36.06 
 
 
430 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.156521 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3192  Protein of unknown function DUF650  35.6 
 
 
427 aa  178  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.201215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2606  Protein of unknown function DUF650  37.37 
 
 
433 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1371  hypothetical protein  56.13 
 
 
164 aa  159  7e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0299368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>