31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0537 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0537  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 339 aa  679    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1612  FAD dependent oxidoreductase  68.44 
 
 		 342 aa  494  1e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0637  FAD dependent oxidoreductase  72.34 
 
 		 342 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0669  FAD dependent oxidoreductase  68.53 
 
 		 348 aa  472  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0497  FAD dependent oxidoreductase  50.45 
 
 		 351 aa  338  7e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.317622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0540  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.711778 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1006  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 492 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 819 aa  53.1  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 376 aa  52.8  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 500 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 500 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  29.02 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1292  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 416 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 419 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1933  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  27.15 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 416 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2211  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  27.15 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0305  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  27.15 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1236  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  27.15 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0948  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  27.15 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1670  hypothetical protein  27.15 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0636  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188486  normal  0.91294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>