43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3986 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3986  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262813  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00655  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  146  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2950  hypothetical protein  42.11 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.120168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1305  hypothetical protein  44.66 
 
 		 169 aa  100  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0338  hypothetical protein  40.57 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000351348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0412  hypothetical protein  45.79 
 
 		 176 aa  90.5  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2962  hypothetical protein  38.18 
 
 		 180 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0939229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1126  hypothetical protein  39.09 
 
 		 183 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4148  hypothetical protein  41.58 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1444  hypothetical protein  43.75 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.273597  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3831  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2206  transmembrane prediction  41.67 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3916  hypothetical protein  45.1 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.80625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2932  hypothetical protein  38.39 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2150  hypothetical protein  48.24 
 
 		 172 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1823  hypothetical protein  41.82 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1935  hypothetical protein  32.17 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.0079788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2214  hypothetical protein  39 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1853  hypothetical protein  38 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3098  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3114  hypothetical protein  36.27 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5497  hypothetical protein  35.04 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4322  hypothetical protein  43.64 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0257021 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5229  hypothetical protein  36.89 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183804  normal  0.664868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1501  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522888  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2444  hypothetical protein  39.58 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32818  predicted protein  36.7 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.179933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2739  hypothetical protein  39.58 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.375128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2516  hypothetical protein  39.58 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4412  hypothetical protein  42.2 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91553  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01610  conserved hypothetical protein  32.03 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00061  conserved hypothetical protein  37.6 
 
 		 237 aa  70.1  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0240751  normal  0.829799 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1979  hypothetical protein  35 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1752  hypothetical protein  43.84 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1466  hypothetical protein  36.26 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.967848 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0483  hypothetical protein  32 
 
 		 212 aa  67  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.344031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26814  predicted protein  33.61 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1703  hypothetical protein  36.63 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1750  hypothetical protein  34.65 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0114  hypothetical protein  34.65 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3851  hypothetical protein  29.01 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0983307  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03090  expressed protein  31.09 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3265  hypothetical protein  38.67 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.460792  decreased coverage  0.00938661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>