37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3299 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  865    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  37.67 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  28.84 
 
 		 428 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  27.52 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  29.69 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  26.6 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  26.37 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  26.37 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  25.77 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  26.02 
 
 		 425 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  25.77 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  25.77 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  25.77 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  25.77 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 214 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  23.06 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  23.37 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  22.67 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1683  hypothetical protein  27.91 
 
 		 82 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1684  hypothetical protein  26.92 
 
 		 90 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  33.71 
 
 		 103 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  22.46 
 
 		 483 aa  46.6  0.0009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>