20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2822 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0882  hypothetical protein  94.27 
 
 		 462 bp  638    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2822    100 
 
 		 526 bp  1043    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.348547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  86.07 
 
 		 984 bp  107  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0324    96.67 
 
 		 1072 bp  103  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1903    93.55 
 
 		 294 bp  91.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.475323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1891  hypothetical protein  93.55 
 
 		 282 bp  91.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0968577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  85.71 
 
 		 984 bp  83.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1902  hypothetical protein  83.62 
 
 		 444 bp  79.8  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.266524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4372    93.88 
 
 		 808 bp  73.8  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1693    91.23 
 
 		 1055 bp  73.8  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514185  normal  0.247616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  83.19 
 
 		 984 bp  73.8  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  84.78 
 
 		 984 bp  71.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1890  hypothetical protein  84.21 
 
 		 444 bp  69.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0896786  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    91.67 
 
 		 902 bp  63.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1695    91.67 
 
 		 1086 bp  63.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.165602  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    91.67 
 
 		 1107 bp  63.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2002    90.2 
 
 		 756 bp  61.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.923889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  90.91 
 
 		 984 bp  56  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  90.91 
 
 		 984 bp  56  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2502    87.04 
 
 		 1090 bp  52  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.674339  normal  0.0724762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>