50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2726 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  567  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  78.72 
 
 		 287 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1302  MadN protein  59.51 
 
 		 291 aa  341  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  57.64 
 
 		 292 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  57.29 
 
 		 292 aa  332  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  56.49 
 
 		 291 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2439  MadN protein  57.55 
 
 		 295 aa  322  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  55.2 
 
 		 284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3134  hypothetical protein  54.78 
 
 		 292 aa  310  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1597  hypothetical protein  55.87 
 
 		 292 aa  309  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.483215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.44 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  54.14 
 
 		 299 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0261  hypothetical protein  56.51 
 
 		 290 aa  298  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.5 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.86 
 
 		 299 aa  291  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.86 
 
 		 299 aa  291  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.35 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0684  hypothetical protein  51.97 
 
 		 287 aa  285  7e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.35 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  51.75 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1433  carboxylate/amino acid/amine transporter  51.8 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720857  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1276  hypothetical protein  51.61 
 
 		 288 aa  281  6.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00521241  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  50.34 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  50 
 
 		 299 aa  278  9e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0864049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  50 
 
 		 299 aa  278  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  50 
 
 		 299 aa  278  9e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  50 
 
 		 299 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  50 
 
 		 299 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  50 
 
 		 299 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  50 
 
 		 299 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  51.91 
 
 		 265 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0339  hypothetical protein  55.87 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.252118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1301  carboxylate/amino acid/amine transporter  56.57 
 
 		 290 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0183  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.08 
 
 		 299 aa  268  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3830  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.63 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4043  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.88 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4083  hypothetical protein  51.08 
 
 		 292 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4537  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.88 
 
 		 291 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1354  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.88 
 
 		 291 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.117278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1652  hypothetical protein  50.35 
 
 		 286 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3822  hypothetical protein  50.72 
 
 		 292 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19150  hypothetical protein  49.65 
 
 		 286 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.475633 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0974  conserved hypothetical protein, MadN family (DUF6 domain protein)  41.3 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.634271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  37.5 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.76 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.58 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.83 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  25.44 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1614  hypothetical protein  26.89 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.90138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  22.97 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>