32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2099 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2099  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  206  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  38.61 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  38.54 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  38.54 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  38.3 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  37.23 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  34.74 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  33.33 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  30.3 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  30.3 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  30.3 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  30.3 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  30.3 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  29.79 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  34.04 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01009  hypothetical protein  30.69 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1235  chaperone-modulator protein CbpM  30.69 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2315  chaperone-modulator protein CbpM  30.69 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01002  modulator of CbpA co-chaperone  30.69 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2125  chaperone-modulator protein CbpM  30.69 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2596  chaperone-modulator protein CbpM  30.69 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1117  chaperone-modulator protein CbpM  30.69 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1111  chaperone-modulator protein CbpM  30.69 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2643  chaperone-modulator protein CbpM  30.69 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.813926  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  30.77 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  35.42 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  31.33 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  28.21 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>