31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1983 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1983  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  279  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3410  hypothetical protein  47.79 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0412  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0795  hypothetical protein  39.04 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0742  putative transmembrane protein  37.24 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.552808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0341  putative transmembrane protein  36.49 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0728  membrane protein-like protein  45.79 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0330  putative transmembrane protein  35.81 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1465  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00433461  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15711  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1658  hypothetical protein  37.06 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.962451 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15561  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00215073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0458  putative transmembrane protein  34.93 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15341  hypothetical protein  35.76 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63840  hypothetical protein  40.94 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1001  hypothetical protein  34.51 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.379029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0819  hypothetical protein  34.01 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.490622  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86791  predicted protein  31.25 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0848  transmembrane protein  31.97 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0906  hypothetical protein  35.21 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0209666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0829  hypothetical protein  31.97 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14221  hypothetical protein  29.73 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5547  hypothetical protein  40.19 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16701  hypothetical protein  31.29 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18271  hypothetical protein  30.07 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0812  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353127  normal  0.980165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1243  hypothetical protein  34.53 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_7235  predicted protein  29.86 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1252  hypothetical protein  34.06 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.380543  normal  0.0148003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0668  putative transmembrane protein  33.91 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0863  membrane protein-like protein  25.71 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>