13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1305 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1305  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1304  hypothetical protein  23.87 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2859  hypothetical protein  24.29 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4915  hypothetical protein  25 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00458522  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0612  hypothetical protein  24.79 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10358  hypothetical protein  25.17 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.834862  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5311  hypothetical protein  23.62 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2871  hypothetical protein  23.56 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1756  hypothetical protein  24.14 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1214  hypothetical protein  22.43 
 
 		 294 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  24.04 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1287  hypothetical protein  22.05 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2568  hypothetical protein  23.24 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>