16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04179 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04179  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  570  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.697119  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0392  hypothetical protein  74.37 
 
 
280 aa  431  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2036  hypothetical protein  64.26 
 
 
282 aa  374  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1957  hypothetical protein  64.26 
 
 
282 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0511  methyltransferase type 11  42.49 
 
 
297 aa  140  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0443  Spermine synthase  32.58 
 
 
293 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0729  hypothetical protein  35.68 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2066  hypothetical protein  35.48 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0955  methyltransferase-like protein  36.32 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2294  hypothetical protein  32.57 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0248697 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1936  hypothetical protein  36.76 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.31207  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37177  predicted protein  35.84 
 
 
239 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0215141  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0951  DNA methylase  35.56 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  29.68 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  30.32 
 
 
293 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.416635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>