More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00239 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00239  transposase  100 
 
 
175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  80.79 
 
 
281 aa  235  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  81.46 
 
 
281 aa  235  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  80.13 
 
 
281 aa  232  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  79.47 
 
 
281 aa  230  9e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00732  transposase  83.8 
 
 
174 aa  229  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  80.13 
 
 
281 aa  228  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  80.41 
 
 
257 aa  228  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  78.81 
 
 
281 aa  228  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01958  transposase  80.13 
 
 
241 aa  227  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.064583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  78.15 
 
 
281 aa  223  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  77.48 
 
 
281 aa  222  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  78.15 
 
 
281 aa  220  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  78.15 
 
 
281 aa  220  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  79.47 
 
 
281 aa  209  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  79.47 
 
 
281 aa  209  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1302  putative transposase  67.79 
 
 
173 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04077  transposase  81.36 
 
 
165 aa  178  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03026  transposase  81.36 
 
 
118 aa  174  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02556  transposase  82.83 
 
 
99 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02529  transposase  82.83 
 
 
99 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00700  transposase  82.83 
 
 
99 aa  149  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.782248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01971  transposase  83.33 
 
 
97 aa  148  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0526075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03797  transposase  83.87 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03280  transposase  83.87 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.495134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02482  transposase  81.82 
 
 
99 aa  144  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02571  transposase  80.56 
 
 
137 aa  136  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  39.88 
 
 
309 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  39.88 
 
 
309 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  39.88 
 
 
309 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  42.57 
 
 
279 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  46.27 
 
 
280 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01378  transposase  84.13 
 
 
64 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  41.79 
 
 
274 aa  101  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  43.07 
 
 
274 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4649  IS1477 transposase  41.78 
 
 
203 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.220345  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  35.12 
 
 
284 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  39.72 
 
 
312 aa  98.6  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  42.42 
 
 
277 aa  97.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1077  IS407A, transposase OrfB  42.75 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2087  IS407A, transposase OrfB  42.75 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.879853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2268  IS407A, transposase OrfB  42.75 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2283  IS407A, transposase OrfB  42.75 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64128  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0043  A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0195  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.434557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0291  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0238689  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0366  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0269645  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0531  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603629  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0629  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000121323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0751  A, transposase OrfB  42.75 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0782  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1265  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.399396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1345  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1457  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1629  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00878015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1734  A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899598  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1746  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1749  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3409  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3477  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3523  A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0023  IS1404 transposase  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0026  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0068  IS1404 transposase  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0117  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0159  IS1404 transposase  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0183  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0263  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0587266  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0283  IS407A, transposase OrfB  42.75 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0565  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0644  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.491667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0736  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0817  IS407A, transposase OrfB  42.42 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>