More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3461 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3461  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
372 aa  762    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3242  glycerophosphodiester phosphodiesterase  94.89 
 
 
380 aa  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0616316  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2910  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  68.57 
 
 
375 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34250  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  68.57 
 
 
375 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.944592  hitchhiker  0.0075965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4314  glycerophosphodiester phosphodiesterase  61.87 
 
 
375 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1048  glycerophosphodiester phosphodiesterase  56.84 
 
 
355 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0978  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.47 
 
 
309 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0959  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.47 
 
 
309 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2205  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.67 
 
 
314 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3517  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.67 
 
 
314 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3514  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  35.55 
 
 
314 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3270  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.97 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3300  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.97 
 
 
314 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3560  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.97 
 
 
314 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3503  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.92 
 
 
314 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.26 
 
 
314 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase GlpQ, putative  36 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1745  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.39 
 
 
314 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68144  normal  0.568819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3525  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.26 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2733  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.03 
 
 
287 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2446  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.39 
 
 
287 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000022465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2703  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  33.97 
 
 
287 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000518352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2415  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.39 
 
 
287 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0307  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.66 
 
 
319 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2682  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.44 
 
 
287 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205547 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.08 
 
 
287 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0579361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2668  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.08 
 
 
287 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.476095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2623  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.44 
 
 
293 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2689  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.24 
 
 
292 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.693483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2472  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.57 
 
 
291 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.97 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000747655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.74 
 
 
320 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1217  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  37.77 
 
 
296 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  29.43 
 
 
241 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4375  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.13 
 
 
298 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798522  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2842  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  36.36 
 
 
416 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0933431  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.79 
 
 
1372 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2522  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.79 
 
 
356 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2418  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.79 
 
 
356 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2510  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.92 
 
 
356 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2626  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.79 
 
 
356 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.538824 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.39 
 
 
419 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2467  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.79 
 
 
356 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.52374  normal  0.0759304 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1072  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.39 
 
 
419 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5040  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.2 
 
 
276 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5128  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.2 
 
 
276 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5420  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.69 
 
 
276 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2954  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.84 
 
 
631 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.35594  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1140  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.03 
 
 
273 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00521525  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2391  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.54 
 
 
358 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2729  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  41.96 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.560439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0198  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.83 
 
 
359 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482615  normal  0.0536804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02165  periplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.27 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2536  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.27 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3376  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.27 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0237  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.71 
 
 
331 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02124  hypothetical protein  27.27 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0198  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.74 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00238018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.36 
 
 
397 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5667  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.01 
 
 
273 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258239  normal  0.0111985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4713  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.15 
 
 
350 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2384  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.93 
 
 
374 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0398882  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.68 
 
 
594 aa  96.7  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4210  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.66 
 
 
383 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.03 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.43101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2379  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.03 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1412  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.05 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.308397 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2621  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.03 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13876  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase glpQ1  33.16 
 
 
274 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.29336e-18  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0332  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.53 
 
 
395 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0425  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.23 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48120  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.99 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000260107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2872  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.76 
 
 
341 aa  94  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0133  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.5 
 
 
252 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0695  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.09 
 
 
377 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.656465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7586  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.22 
 
 
335 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.5 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.62 
 
 
383 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3992  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.27 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.220581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0224  glycerophosphodiester phosphodiesterase  25.81 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0868  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.69 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.672761  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3959  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.07 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0259448  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.06 
 
 
379 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6042  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.08 
 
 
406 aa  90.1  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0393  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.77 
 
 
379 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.76423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5023  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.47 
 
 
263 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215584  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  39.58 
 
 
248 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000464019  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0949  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.16 
 
 
259 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.886696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4513  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.62 
 
 
263 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.38 
 
 
299 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0002  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.33 
 
 
355 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000133502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2972  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.62 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.74647 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.55 
 
 
769 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3745  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.49 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191864  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0950  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.21 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1259  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.39 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0649127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03310  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.43 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0177  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.73 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1712  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.33 
 
 
352 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2633  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.53 
 
 
367 aa  87  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>