More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02165 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02165  periplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  100 
 
 
358 aa  746    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  99.44 
 
 
358 aa  741    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.43101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2536  glycerophosphodiester phosphodiesterase  99.72 
 
 
358 aa  743    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2621  glycerophosphodiester phosphodiesterase  99.16 
 
 
358 aa  739    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2467  glycerophosphodiester phosphodiesterase  89.64 
 
 
356 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.52374  normal  0.0759304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2391  glycerophosphodiester phosphodiesterase  98.88 
 
 
358 aa  739    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2522  glycerophosphodiester phosphodiesterase  89.64 
 
 
356 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2418  glycerophosphodiester phosphodiesterase  89.64 
 
 
356 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2379  glycerophosphodiester phosphodiesterase  99.44 
 
 
358 aa  741    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3376  glycerophosphodiester phosphodiesterase  99.72 
 
 
358 aa  743    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1412  glycerophosphodiester phosphodiesterase  99.16 
 
 
358 aa  739    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.308397 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02124  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  746    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2626  glycerophosphodiester phosphodiesterase  89.36 
 
 
356 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.538824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2510  glycerophosphodiester phosphodiesterase  89.64 
 
 
356 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0198  glycerophosphodiester phosphodiesterase  76.88 
 
 
359 aa  585  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482615  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0224  glycerophosphodiester phosphodiesterase  73.57 
 
 
371 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3992  glycerophosphodiester phosphodiesterase  78.51 
 
 
371 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.220581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3959  glycerophosphodiester phosphodiesterase  77.2 
 
 
361 aa  551  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0259448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0198  glycerophosphodiester phosphodiesterase  73.1 
 
 
360 aa  544  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00238018  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0564  glycerophosphodiester phosphodiesterase  85.99 
 
 
291 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0510  glycerophosphodiester phosphodiesterase  60.89 
 
 
361 aa  467  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.554252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3177  glycerophosphodiester phosphodiesterase  61.38 
 
 
359 aa  448  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03310  glycerophosphodiester phosphodiesterase  60.72 
 
 
356 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002678  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  61.24 
 
 
351 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0855489  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0002  glycerophosphodiester phosphodiesterase  61.3 
 
 
355 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000133502  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1712  glycerophosphodiester phosphodiesterase  59.83 
 
 
352 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1401  glycerophosphodiester phosphodiesterase  44.24 
 
 
329 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000351864  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02740  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.83 
 
 
394 aa  246  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1551  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.78 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4210  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.03 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48120  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.78 
 
 
370 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000260107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4713  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.11 
 
 
350 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.6 
 
 
360 aa  176  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2209  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.84 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0235433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0332  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.17 
 
 
395 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.16 
 
 
397 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, periplasmic  36.54 
 
 
383 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000316579  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0440  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.51 
 
 
385 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1072  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.92 
 
 
419 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.92 
 
 
419 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2756  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.35 
 
 
396 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.721808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3422  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.35 
 
 
396 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236253  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38180  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.82 
 
 
396 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0177  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.26 
 
 
369 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.45 
 
 
368 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0245  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.56 
 
 
332 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.710509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3745  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.88 
 
 
389 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191864  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0237  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.52 
 
 
412 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.6 
 
 
2668 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4172  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.48 
 
 
333 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536145  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1298  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.89 
 
 
399 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0120956  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7923  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.43 
 
 
358 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0695  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.93 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.656465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2872  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.53 
 
 
341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.06 
 
 
383 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.05 
 
 
1027 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2432  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.73 
 
 
390 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0322751  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4038  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.3 
 
 
371 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.690604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03494  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31 
 
 
366 aa  145  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01400  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.85 
 
 
408 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6906  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.79 
 
 
381 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.79 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0393  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.21 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.76423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12050  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.82 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0051177  normal  0.272152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1259  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.68 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0649127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6042  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.75 
 
 
406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0425  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.49 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3369  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.77 
 
 
381 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3256  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.78 
 
 
381 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.89 
 
 
1372 aa  135  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1750  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.39 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102428  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4105  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.58 
 
 
381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4261  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.58 
 
 
381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.036739  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4776  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.22 
 
 
356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.82712  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3685  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.83 
 
 
381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1884  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.7 
 
 
378 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2022  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.7 
 
 
378 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.779674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3194  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.7 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4158  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.29 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4329  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00293344  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0892  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.7 
 
 
378 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2725  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.7 
 
 
378 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1046  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.69 
 
 
375 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413626  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3177  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.7 
 
 
378 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3140  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.7 
 
 
378 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2633  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.4 
 
 
367 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0502  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, periplasmic precursor protein  29.6 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.496674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1425  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.7 
 
 
378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.830481  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.97 
 
 
769 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2384  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.77 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0398882  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0859  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.79 
 
 
356 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0562  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase (glycerophosphodiester phosphodiesterase)  53.57 
 
 
89 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.03 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1745  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.76 
 
 
314 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68144  normal  0.568819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3503  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.35 
 
 
314 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3514  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  27.03 
 
 
314 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3270  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.03 
 
 
314 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3517  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.03 
 
 
314 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2205  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.25 
 
 
314 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1048  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.76 
 
 
355 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>